請問t4ligase的連線效率如何?我用酶切產物進行連線,看不見連線產物,也P不到

時間 2022-06-29 11:30:15

1樓:匿名使用者

。。。。。。

ligation的話連結成功了出菌落了就好啊, 沒有必要一定要需要在膠上看見, 或者是要pcr能看見的。

因為本身連結本身所需要的vector和insert的dna量就很小。 如果能看見的話那需要大含量的ligation, 沒有那個必要, 除非是你出現問題了。

可是即使是出現問題了, ligation技術本身的特點也註定不是肯定可以看得到產物的。 雖然我知道的確有人這麼作。

t4 ligation總的來說還是不錯的, 如果覺得不理想建議換幾種連結方式, 比如16度o.n啊, 比如4度o.n啊, 比如室溫3小時啊, 等等, 比較起來我覺得t4的ligation是相當好的了, 比快速的那種我個人經驗要穩定, 如果短期不容易成功推薦選on的那種ligation方式。

另外vec:ins的比例多換幾種, 多嘗試幾次總會成功的, 你ligation成功了就可以繼續了啊, 跟膠和pcr較什麼勁。

不知道你用的是哪種t4了, 我以上說的是promega的t4。 公司不一樣效率也有所差異是真的了。

2樓:匿名使用者

哪個公司的t4? 你的連線體系裡atp含量多少?你的問題太籠統了啊

連線反應產物,是否可以直接做pcr模板?要不要先滅活其中的t4連線酶?

3樓:匿名使用者

這樣做實際上是不可行的,效率會很低。我以前也想你一樣試過。

原因:粘性末端相連的機會不大,而且要6個同時都相連,機會是呈指數級別下降的。而且如果直接做pcr的話,那些沒有連線或者部分連線的片段十個極大的干擾。

2個方案:既然酶切位點獨特,建議把a和f修改為直接可以和質粒互補的末端,連線後直接克隆。比做pcr的可能性要大。

或者先做ab, cd, ef連線,克隆後再做兩次abcd+ef連線。

4樓:

連線產物可以用來直接作為pcr的模板,我做過。不放心的話可以65度20分鐘處理一下。

我覺得這樣做是可行的。但是最終的pcr產物可能會有各種非特異性擴增,切膠**時要注意片段大小是否正確

5樓:匿名使用者

博凌科為-為你解答:理論上講,你可以這樣做,甚至可以直接做pcr而不用連線。這個其實和多對分段克隆基因的原理一樣,都是讓前一對引物的下游引物,和後一對引物的上游引物有一段互補序列。

這樣所獲得的pcr片段就是前一段的末端和後一段的前端就會有互補序列。但是問題是,這樣的前後序列一般有15個鹼基左右的互補序列,而酶切位點的互補序列太短。這個需要你把pcr反應的退火溫度降低。

來保證鹼基互補。

6樓:匿名使用者

你這個想法理論上講是可行的,但是實際操作起來就會存在很大的困難。小片段連線比較難做。根據你的敘述,最後連線好的片段約為200bp左右。

我建議你把這200bp的片段分成4段,即1,2,3,4段,合成有15個鹼基互補的4條引物,1與2,3與4做一次重疊延伸,然後以1與2,3與4的產物為模板,1和4為引物在做一次重疊延伸pcr,這樣就ok了,速度會很快的。分成4段是因為引物合成鹼基個數小於60個的,按正常收費,這樣節約成本。

那為什麼連線表達載體時沒將t4連線酶混進那個載體附帶的mix液中呢?

7樓:匿名使用者

因為不同的實驗會根據不同的插入片段選擇不同的連線酶,除了t4之外還有其他的dna連線酶。你需要檢視說明書,看看哪種buffer可以讓酶切效率達到最佳數值。當然如果是雙酶切的話,你可能需要上網查詢相應buffer了。

希望能夠幫到你!

8樓:

厄。。。什牌子的啊。。。我用的都是分開的哦。。。buffer,酶等等。。。沒有mix的呢。

如何增加t4 dna連線酶的連線效率

9樓:匿名使用者

加入peg8000,反應體系終濃度5%

10樓:smile我的愛人

buffer中加入鎂離子

我做連線,用swaⅰ酶切,平頭末端,用t4連線酶25度反應一小時,總是不成功,能給分析一下原因或有好的方法 10

11樓:匿名使用者

平頭連線本來就沒有粘性末端連線容易,一般我們永t4連線的話是16度過夜,成功率很高。也可4度冰箱放久點。說明書說25度也是可以的,我們一直沒有試過。

如果前面的實驗都正確的,建議採用16度水浴過夜

t4連線酶連線後產物怎麼處理?直接轉化嗎?

12樓:匿名使用者

加乙酸鈉和無水乙醇沉澱出來,70%酒精洗滌,再用te融解,再轉化

問:哪有參考的資料:

t4連線酶的說明書,takara的

13樓:匿名使用者

連線足夠時間

就可以做轉化了啊

這麼常規的技術,找個操作流程就好了,請問你還要什麼樣的參考資料?

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